Ich wohne hier ja an der Strecke Freiburg-Basel und sehe fast täglich die Rola-Hupac Züge vorbeifahren.

Meine Frage wäre nun, ob die ROLA-Züge grundsätzlich nur als "Sortenreine" Ganzzüge fahren?
Aufgrund des Ladevorgangs und nötigen Begleitwagens macht das ja Sinn.

Trotzdem wäre es doch denkbar das ein ROLA-Zug mal ein paar Taschenwagen/Doppeltragwagen etc. mitnehmen, oder gibts das tatsächlich nicht?

Dazu müsstest du aber immer am Anfang und am Ende einer solchen Wagengruppe im Zugverband einen Endwagen mit Standard-Kupplung haben, zwischen den RoLa-Wagen sind ja diese niedrigen Spezialkupplungen angebracht... von mir also ein eher nein. Aber auf der Verbindung Singen - Italien fahren keine RoLa mehr, sondern nur noch UKV-Züge, solche Wagen sieht man doch hin und wieder auf dem Weg in den Unterhalt irgenwo in einen bunten Dg eingereiht.

Eher ein klares NEIN.

Die Wagen werden in ganzen Zügen gefahren (Liegewagen nicht vergessen) und von einer Gesellschaft (z.B. HUPAC) abgewickelt. Somit werden eigene Trassen angemietet und auch gefahren.
Des weiteren Beginnen und Enden RoLa Züge oft in eigenen Anschlüßen an Straßen und Autobahnen und nicht in Güterbahnhöfen, wo die anderen Wagen des gemischten Zuges ja behandelt werden. Auch wäre es kaum möglich, mit dem besetzten Bc im Güterbahnhof umzugehen.

Sollte ab und zu mal ein RoLa Wagen im Güterzug auftauchen, hat dies meist andere Gründe. Z.B. Zuführung zum Ziel nach Wagenstörung und Aussetzen aus dem Zugverband.

Manchmal aber doch,

zummindestens in der Epoche IV.
Linienbusse wurden auf einzelnen Wagen mit der Bahn transportiert, die in Güterzügen eingestellt waren.
Dazu wurden die langen RoLa-Wagen (Saadkmmss 690) verwendet. An diese Wagen konnte an den Enden jeweils eine Pufferbohle angebaut werden.

Somit handelt es sich nicht um RoLa Verkehr, sondern um einen Fracht-"Transport".

Also in Tirol fahren auch RoLa-Züge und zwar ausnahmslos als Ganzzüge. Sie enden am Brenner an einem eigenen Gleis und fahren im Pendelverkehr zwischen Wörgl-Brenner, jeweils mit einer 1116 oder 1216 und einer 1144 (an den Zugenden).
Gruß,
Transalpin